Стандартно, SS - Slave Select - указание устройству с интерфейсом SPI в режиме MASTER переключиться в режим SLAVE. CS - Chip Select - уведомление SLAVE устройства с интерфейсом SPI о том, что сейчас с ним будет обмениваться информацией MASTER.
В обсуждаемом шилде пин SS проходной и никак не связан с шилдом - необходим для прошивки контроллера нижней платы, но для этого необходимо снять джамперы с колодки JP1 и воспосльзоваться четными номерами пинов). Пин CS присутствует на колодке WP1 и продублирован на JP1. Данная колодка предназначена для подключения шилда с помощью проводов к любому другому МК.
